Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm8888J3QPX5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm8888J3QPX5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm8888J3QPX5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm8888J3QPX5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm8888J3QPX5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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