Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3685J3QPP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3685J3QPP2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms