Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms