Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm2035J3QP87 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms