Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm21900J3QP38 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm21900J3QP38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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