Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10428J3QNV7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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