Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20815J3KMI0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm20815J3KMI0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20815J3KMI0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms