Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arfip1G5E8V9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms