Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcf11G3X9Z4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms