Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Arfgef1G3X9K3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms