Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms