Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Colca2F8VPY8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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