Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm7535F7CXE4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7535F7CXE4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms