Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm5861F6VCN9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms