Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atf6F6VAN0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atf6F6VAN0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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