Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf212F6TQD1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf212F6TQD1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms