Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms