Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgef5E9Q7D5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms