Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate1E9Q658 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms