Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BC051665E9Q623 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BC051665E9Q623 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms