Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BC005561E9Q5E2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms