Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Ccdc71lE9Q4T4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc71lE9Q4T4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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