Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tarbp1E9Q368 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tarbp1E9Q368 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms