Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt78E9Q0F0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms