Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gcom1E9PZ54 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcom1E9PZ54 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms