Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3298E9PW80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms