Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms