Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clca3bE9PUL3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms