Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms