Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5934D3Z4U6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5934D3Z4U6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms