Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc6D3YZP9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc6D3YZP9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms