Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC048679D3YXE9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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BC048679D3YXE9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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BC048679D3YXE9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BC048679D3YXE9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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