Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kpna7C0LLJ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kpna7C0LLJ0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms