Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms