Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms