Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp26c1B2RXA7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp26c1B2RXA7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms