Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rd3lB2RV38 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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