Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zscan5bB2RTN3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zscan5bB2RTN3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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