Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rrn3B2RS91 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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