Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nfx1B1AY10 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nfx1B1AY10 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms