Protein–RNA interactions for Protein: B1AX39

Zcchc7, Zinc finger CCHC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc7B1AX39 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zcchc7B1AX39 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zcchc7B1AX39 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc7B1AX39 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms