Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spocd1B1ASB6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spocd1B1ASB6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms