Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Grik3B1AS29 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms