Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn8B1ARD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn8B1ARD8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms