Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem238A9JSM3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms