Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prr16A3KMN5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prr16A3KMN5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms