Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6880A3KG45 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6880A3KG45 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm6880A3KG45 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms