Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatsperbA2RTF1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatsperbA2RTF1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms