Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trgv2A2J008 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trgv2A2J008 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms