Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga8A2ARA8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms